MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Mycobacterium smegmatis JS623

Total Repeats: 157973

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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6002	NC_019966	CGGCG	2	10	237420	237429	0 %	0 %	60 %	40 %	433645076
6003	NC_019966	CAG	2	6	237439	237444	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433645076
6004	NC_019966	GCC	2	6	237460	237465	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433645076
6005	NC_019966	CGG	2	6	237504	237509	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433645076
6006	NC_019966	CCT	2	6	237600	237605	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	433645076
6007	NC_019966	CGG	2	6	237675	237680	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433645076
6008	NC_019966	CGCGA	2	10	237686	237695	20 %	0 %	40 %	40 %	433645076
6009	NC_019966	CGC	2	6	237708	237713	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433645076
6010	NC_019966	GCG	2	6	237717	237722	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433645076
6011	NC_019966	TCG	2	6	237767	237772	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433645076
6012	NC_019966	GCA	2	6	237777	237782	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433645076
6013	NC_019966	CGC	2	6	237927	237932	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433645076
6014	NC_019966	CG	3	6	238030	238035	0 %	0 %	50 %	50 %	433645076
6015	NC_019966	GTGC	2	8	238044	238051	0 %	25 %	50 %	25 %	433645076
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6017	NC_019966	CAC	2	6	238120	238125	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	433645076
6018	NC_019966	TCC	2	6	238274	238279	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	433645076
6019	NC_019966	TGC	2	6	238280	238285	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433645076
6020	NC_019966	TCT	2	6	238296	238301	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	433645076
6021	NC_019966	GAT	2	6	238315	238320	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	433645076
6022	NC_019966	GCC	2	6	238369	238374	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433645076
6023	NC_019966	GCTG	2	8	238383	238390	0 %	25 %	50 %	25 %	433645076
6024	NC_019966	CCT	2	6	238458	238463	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	433645076
6025	NC_019966	GTT	2	6	238489	238494	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	433645076
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6029	NC_019966	CGCA	2	8	238669	238676	25 %	0 %	25 %	50 %	433645076
6030	NC_019966	CGC	2	6	238683	238688	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433645076
6031	NC_019966	GAC	3	9	238699	238707	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433645076
6032	NC_019966	ATAA	2	8	238736	238743	75 %	25 %	0 %	0 %	433645076
6033	NC_019966	ACT	2	6	238749	238754	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6034	NC_019966	CCA	2	6	238813	238818	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	433645077
6035	NC_019966	ATG	2	6	238821	238826	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	433645077
6036	NC_019966	ATC	2	6	238839	238844	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	433645077
6037	NC_019966	CGA	2	6	238957	238962	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433645077
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6039	NC_019966	ATG	2	6	239103	239108	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	433645077
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6042	NC_019966	GAT	2	6	239144	239149	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	433645077
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6048	NC_019966	GTA	2	6	239417	239422	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	433645077
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6052	NC_019966	CCA	2	6	239501	239506	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	433645077
6053	NC_019966	CGGT	2	8	239508	239515	0 %	25 %	50 %	25 %	433645077
6054	NC_019966	CGG	2	6	239578	239583	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433645077
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6058	NC_019966	AGCTCC	2	12	239754	239765	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	433645078
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6060	NC_019966	GCG	2	6	239825	239830	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433645078
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6063	NC_019966	GTTA	2	8	239983	239990	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
6064	NC_019966	AGGT	2	8	240034	240041	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
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6104	NC_019966	TCG	2	6	241527	241532	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433645081
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6120	NC_019966	CGT	2	6	242121	242126	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433645081
6121	NC_019966	CCCA	2	8	242135	242142	25 %	0 %	0 %	75 %	433645081
6122	NC_019966	GAC	2	6	242174	242179	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433645081
6123	NC_019966	GTC	2	6	242228	242233	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433645081
6124	NC_019966	CGC	2	6	242236	242241	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433645081
6125	NC_019966	GCT	2	6	242382	242387	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433645081
6126	NC_019966	GTC	2	6	242423	242428	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433645081
6127	NC_019966	GCC	2	6	242450	242455	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433645081
6128	NC_019966	GCGAT	2	10	242520	242529	20 %	20 %	40 %	20 %	433645081
6129	NC_019966	GTC	2	6	242558	242563	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433645081
6130	NC_019966	ACG	2	6	242565	242570	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433645081
6131	NC_019966	GCT	2	6	242620	242625	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433645081
6132	NC_019966	GGC	2	6	242627	242632	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433645081
6133	NC_019966	CGT	3	9	242649	242657	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433645081
6134	NC_019966	TGC	2	6	242664	242669	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433645081
6135	NC_019966	GAG	2	6	242684	242689	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	433645081
6136	NC_019966	CCGG	2	8	242720	242727	0 %	0 %	50 %	50 %	433645081
6137	NC_019966	GGT	2	6	242735	242740	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	433645081
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6139	NC_019966	CAA	2	6	242794	242799	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	433645081
6140	NC_019966	GCT	2	6	242905	242910	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433645081
6141	NC_019966	GATT	2	8	243030	243037	25 %	50 %	25 %	0 %	433645081
6142	NC_019966	GTG	2	6	243080	243085	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	433645081
6143	NC_019966	AGA	2	6	243180	243185	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	433645081
6144	NC_019966	GGT	2	6	243199	243204	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	433645081
6145	NC_019966	CGG	2	6	243217	243222	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433645081
6146	NC_019966	CG	3	6	243262	243267	0 %	0 %	50 %	50 %	433645081
6147	NC_019966	GGC	2	6	243296	243301	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433645081
6148	NC_019966	GC	3	6	243321	243326	0 %	0 %	50 %	50 %	433645081
6149	NC_019966	TG	3	6	243422	243427	0 %	50 %	50 %	0 %	433645081
6150	NC_019966	GCA	2	6	243429	243434	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433645081
6151	NC_019966	GTG	2	6	243436	243441	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	433645081
6152	NC_019966	GC	3	6	243505	243510	0 %	0 %	50 %	50 %	433645081
6153	NC_019966	CAAGAT	2	12	243517	243528	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	433645081
6154	NC_019966	GC	3	6	243545	243550	0 %	0 %	50 %	50 %	433645081
6155	NC_019966	TGG	2	6	243628	243633	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	433645081
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6157	NC_019966	GCT	2	6	243655	243660	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433645081
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6160	NC_019966	CCG	2	6	243729	243734	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433645081
6161	NC_019966	CGG	2	6	243775	243780	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433645081
6162	NC_019966	GTC	2	6	243800	243805	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433645081
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6164	NC_019966	CGA	2	6	243957	243962	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433645081
6165	NC_019966	TACGG	2	10	244009	244018	20 %	20 %	40 %	20 %	433645081
6166	NC_019966	CTGC	2	8	244067	244074	0 %	25 %	25 %	50 %	433645082
6167	NC_019966	GGC	2	6	244134	244139	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433645082
6168	NC_019966	CGGCG	2	10	244197	244206	0 %	0 %	60 %	40 %	433645082
6169	NC_019966	CG	3	6	244214	244219	0 %	0 %	50 %	50 %	433645082
6170	NC_019966	TCG	2	6	244223	244228	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433645082
6171	NC_019966	GGC	2	6	244237	244242	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433645082
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6173	NC_019966	GAC	2	6	244288	244293	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433645082
6174	NC_019966	GAT	2	6	244306	244311	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	433645082
6175	NC_019966	AGGTCG	2	12	244358	244369	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	433645082
6176	NC_019966	CA	3	6	244403	244408	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
6177	NC_019966	CGC	2	6	244433	244438	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6178	NC_019966	TTC	2	6	244440	244445	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6179	NC_019966	TGC	2	6	244453	244458	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6180	NC_019966	GCC	2	6	244496	244501	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433645083
6181	NC_019966	CGG	2	6	244514	244519	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433645083
6182	NC_019966	CGG	2	6	244526	244531	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433645083
6183	NC_019966	GGT	2	6	244577	244582	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	433645083
6184	NC_019966	GTG	2	6	244584	244589	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	433645083
6185	NC_019966	CGG	2	6	244636	244641	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433645083
6186	NC_019966	TCG	3	9	244642	244650	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433645083
6187	NC_019966	CGTCGA	2	12	244664	244675	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	433645083
6188	NC_019966	GACACC	2	12	244680	244691	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	433645083
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6193	NC_019966	TGA	2	6	244770	244775	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	433645083
6194	NC_019966	CGA	2	6	244784	244789	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433645083
6195	NC_019966	CGA	2	6	244837	244842	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433645083
6196	NC_019966	CAG	2	6	244868	244873	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433645083
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6198	NC_019966	TCG	2	6	245059	245064	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433645083
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6201	NC_019966	TCA	2	6	245185	245190	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	433645083
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6203	NC_019966	GCG	2	6	245247	245252	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6204	NC_019966	CGC	2	6	245261	245266	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6205	NC_019966	GCGA	2	8	245287	245294	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
6206	NC_019966	GGC	2	6	245299	245304	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433645084
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6210	NC_019966	ACG	2	6	245439	245444	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433645084
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6214	NC_019966	CGT	2	6	245490	245495	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433645084
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6220	NC_019966	ATC	2	6	245921	245926	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	433645084
6221	NC_019966	CTG	2	6	245935	245940	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433645084
6222	NC_019966	CAAC	2	8	245958	245965	50 %	0 %	0 %	50 %	433645084
6223	NC_019966	TCG	3	9	245992	246000	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433645085
6224	NC_019966	GCA	2	6	246071	246076	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433645085
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6227	NC_019966	TCG	2	6	246179	246184	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433645085
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6229	NC_019966	CAC	2	6	246210	246215	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	433645085
6230	NC_019966	CACG	2	8	246228	246235	25 %	0 %	25 %	50 %	433645085
6231	NC_019966	GCA	2	6	246284	246289	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433645085
6232	NC_019966	TTCG	2	8	246335	246342	0 %	50 %	25 %	25 %	433645085
6233	NC_019966	AC	3	6	246397	246402	50 %	0 %	0 %	50 %	433645085
6234	NC_019966	ACA	2	6	246431	246436	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	433645085
6235	NC_019966	GC	3	6	246463	246468	0 %	0 %	50 %	50 %	433645085
6236	NC_019966	CCA	2	6	246539	246544	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	433645085
6237	NC_019966	CAC	2	6	246600	246605	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	433645085
6238	NC_019966	TCG	2	6	246628	246633	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433645085
6239	NC_019966	GCC	2	6	246705	246710	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433645085
6240	NC_019966	CG	3	6	246734	246739	0 %	0 %	50 %	50 %	433645085
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6484	NC_019966	TCG	2	6	257094	257099	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433645096
6485	NC_019966	CCG	2	6	257109	257114	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433645096
6486	NC_019966	CTT	2	6	257126	257131	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	433645096
6487	NC_019966	CGG	3	9	257164	257172	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433645096
6488	NC_019966	CCG	2	6	257275	257280	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433645097
6489	NC_019966	CGT	2	6	257286	257291	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433645097
6490	NC_019966	TGCC	2	8	257375	257382	0 %	25 %	25 %	50 %	433645097
6491	NC_019966	GGT	2	6	257496	257501	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	433645097
6492	NC_019966	AGC	2	6	257512	257517	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433645097
6493	NC_019966	GCG	2	6	257549	257554	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433645097
6494	NC_019966	CGA	2	6	257573	257578	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433645097
6495	NC_019966	TCA	2	6	257627	257632	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	433645097
6496	NC_019966	GCT	2	6	257657	257662	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433645097
6497	NC_019966	GTG	2	6	257685	257690	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	433645097
6498	NC_019966	CTG	2	6	257703	257708	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433645097
6499	NC_019966	TCG	2	6	257719	257724	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433645097
6500	NC_019966	CGT	2	6	257735	257740	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433645097

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